液相色譜法：適于溶解后可制成溶液的樣品或有機(jī)介質(zhì)溶液，不受樣品的揮發(fā)性和熱穩(wěn)定性的限制，百分之七十以上的有機(jī)化合物可用液相色譜分析，特別是高沸點(diǎn)、大分子、揮發(fā)性差、強(qiáng)極性、熱穩(wěn)定性差化合物的分離分析，顯示出優(yōu)勢(shì)。
氣相色譜法：適應(yīng)易于汽化、熱穩(wěn)定性好、且沸點(diǎn)比較低的樣品分析。但不適應(yīng)于對(duì)高沸點(diǎn)、揮發(fā)性差、熱穩(wěn)定性差、離子型及高聚物的樣品分析；色譜法的缺點(diǎn)主要是難以對(duì)未知物分析定性，如果沒(méi)有已知的純樣品或已知純樣品的色譜圖，就很難判斷某一色譜峰究竟代表何物。
氣相色譜儀所能直接分離的樣品是可揮發(fā)、且熱穩(wěn)定的，沸點(diǎn)一般不超過(guò)500℃。據(jù)有關(guān)資料統(tǒng)計(jì)，在目前已知的化合物中，有20%～25%可用氣相色譜儀直接分析，其余原則上均可用液相色譜儀分析。也就是說(shuō)氣相色譜儀的分析對(duì)象遠(yuǎn)沒(méi)有液相色譜儀多。需要指出的是，有些雖然不能用氣相色譜法直接分析的樣品，通過(guò)特殊的進(jìn)樣技術(shù)，如頂空進(jìn)樣和裂解進(jìn)樣，也可用氣相色譜法間接分析。比如高分子材料的裂解色譜就是如此。這在一定程度上擴(kuò)大了氣相色譜法分析對(duì)象的范圍。此外，氣相色譜法比液相色譜更適合于*氣體的分析。
氣相色譜法具有分離能力好，靈敏度高，分析速度快，操作方便等優(yōu)點(diǎn)，但是受技術(shù)條件的限制，沸點(diǎn)太高的物質(zhì)或熱穩(wěn)定性差的物質(zhì)都難于應(yīng)用氣相色譜法進(jìn)行分析。一般對(duì)500℃以下不易揮發(fā)或受熱易分解的物質(zhì)部分可采用衍生化法或裂解法。液相色譜法，只要求試樣能制成溶液，而不需要?dú)饣?，因此不受試樣揮發(fā)性的限制。對(duì)于高沸點(diǎn)、熱穩(wěn)定性差、相對(duì)分子量大(大于 400 以上)的有機(jī)物( 些物質(zhì)幾乎占有機(jī)物總數(shù)的 75% ～ 80% )原則上都可應(yīng)用液相色譜法來(lái)進(jìn)行分離、分析。 據(jù)統(tǒng)計(jì)，在已知化合物中，能用氣相色譜分析的約占20%，而能用液相色譜分析的約占70～80%。
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